| 湯金全(2007年2月1日-2009年7月31日;任期制的獨立機關,不受內閣改組影響) |
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| 范良銹(2008年5月20日-2011年3月31日,政務委員兼任) |
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| 邱正雄(2008年5月20日-2009年9月10日,行政院副院長兼任) |
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| 張政雄(2004年6月16日-2009年11月3日;任期制的獨立機關,不受內閣改組影響) |
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| 吳靜雄(2005年8月12日-2010年5月24日) |
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| 朱文祥代理(2008年2月20日-2009年5月12日) → 邵玉銘 (2009年5月13日-2012年5月20日) |
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| 彭芸(2008年8月1日-2010年8月10日;任期制的獨立機關,不受內閣改組影響) |
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| 史亞平(2008年5月20日-2008年12月31日) → 蘇俊賓(2008年12月31日-2010年2月24日) |
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| 石素梅(2008年5月20日-2016年5月20日) |
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| 陳清秀(2008年5月20日-2009年9月10日) |
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| 彭淮南(1998年2月25日-2018年2月25日 ;任期制部會機關,不受內閣改組影響) |
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| 蔡勳雄(2008年5月20日-2009年9月10日,政務委員兼任) |
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| 薛香川(2008年5月20日-2009年9月10日,行政院秘書長兼任) |
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| 蔡勳雄(2008年5月20日-2010年2月24日,政務委員兼任) |
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| 蔡勳雄(2008年5月20日-2010年2月24日,政務委員兼任) |
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| 蔡勳雄(2008年5月20日-2010年2月24日,政務委員兼任) |
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| 周功鑫(2008年5月20日-2012年7月29日) |
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